先天性心脏病一般与发育有关，所以治疗一般是选择手术治疗，只是根据情况，首先是判断是否能做手术，其次是确定什么时候做手术最合适，然后做出全面的判断，然后才会给出一个计划。
通常来说，复杂先天性心脏病有左向右分流型先天性心脏病、右向左分流型先天性心脏病、无分流型先天性心脏病等。
通常来说，复杂先天性心脏病有左向右分流型先天性心脏病、右向左分流型先天性心脏病、无分流型先天性心脏病等。一种是左至右分流型，又称潜伏青紫色，是一种有血管导管没有闭合的畸形；二是右至左分支，亦称“青紫色”，其特征为主动脉全切及法莫四联症；三是不分流，又称无青紫色，以主动脉和肺动脉为主干和小血管为主。
通常情况下，最复杂的先天性心脏病是法洛四联症。具体情况分析如下：
法洛四联症是一种常见的先天性心脏畸形。其基本病理为室间隔缺损、肺动脉狭窄、主动脉骑跨和右心室肥厚。法洛四联症在儿童发绀型心脏畸形中居首位，治疗上面也比较困难，是由于4种畸形组合而组成的右心室流出道梗阻，室间隔缺损，右心室肥厚以及主动脉骑跨，所以属于是最复杂的先天性心脏病。
先天性心脏病的类型和严重程度决定了其存活时间。有的对生命没有太大的影响，只能通过身体检查来检查，比如房间隔缺损、动脉导管未闭、主动脉狭窄、肺动脉瓣狭窄、三尖瓣下移畸形、主动脉窦动脉瘤等。如果是室间隔缺损、法洛四联症、艾森门格综合征等，都有室间隔缺损，如果房间间隔缺损太大，患者的预后就会变差，必须尽早手术，一旦错过了手术的机会，就很难存活到成人。
先天性心脏病室间隔缺损的治疗原则主要是鉴于室缺有自然闭合的可能，因而对缺损小、年龄小的病儿可随诊观察至2岁-3岁的可以进行手术治疗，对于极小室缺、无症状、胸片、心电图均正常者，可以保守治疗。
室间隔缺损小于0.1-0.3cm时没有任何临床表现其不需要特殊治疗，在1岁半左右可以自行修复。对于缺损比较严重的患儿采用介入治疗和手术治疗，药物治疗可以积极地防止感染性心内膜炎的发生，也可以防止心力衰竭的发生。进行手术治疗需要择期进行，最佳手术年龄在3岁左。
