单纯的血清碱性磷酸酶低于正常范围时，不结合其他检查结果不具有代表性，需要结合其他检查结果，共同进行诊断。另外，在重症慢性肾炎，甲状腺功能不全，严重贫血，营养不良，维生素缺乏，坏血病，呆小症等疾病中会出现碱性磷酸酶降低的现象。
肝功能碱性磷酸酶偏低提示有肝胆疾病。
肝功能碱性磷酸酶高值提示胆管梗阻，低值在儿童和孕妇中最常见。高值提示活动性骨沉积的可能性较大，临床上碱性磷酸酶偏低提示胆道系统疾病，慢性肾炎贫血、甲状腺功能不全、碱性磷酸酶偏低在肝病患者中比较少见，碱性磷酸酶偏低在肝病患者中比较少见。建议患者需要引起一定的重视，及时就医做进一步的检查明确诊断，防止病情加重危害到身体健康。
血清碱性磷酸酶偏高，可能是胆道系统疾病。比如阻塞性黄疸，胆总管梗阻、胆道肿瘤和胰头癌时，会有碱性磷酸酶升高。完全性阻塞性黄疸，有80%碱性磷酸酶可升高到正常值的五倍左右。还有肝细胞性黄疸，碱性磷酸酶会升高到正常值的3倍左右。骨骼系统疾病也会导致碱性磷酸酶升高，比如软骨症，肢端肥大症，佝偻病。
儿童血清碱性磷酸酶高的原因有以下几点：
1.生理因素:儿童正处于生长发育的快速期，碱性磷酸酶是骨代谢的标准。在骨骼生长的过程中，碱性磷酸酶的含量会比较高，然后血清碱性磷酸酶会升高；
2.病理因素:如缺钙时，血清中的碱性磷酸酶会升高，同时会表现出低出血钙、高血磷的现象。还有一些情况是肝细胞功能受损或肝细胞坏死，也可表现为碱性磷酸酶升高。另外，如果碱性磷酸酶明显升高，也要注意恶性肿瘤的可能。
孩子体内的碱性磷酸酶高，主要是由于孩子的生长速度很快，导致体内的碱性磷酸酶也会比较活跃，出现升高的情况。这是一种生理原因，也是孩子独有的。还有一些疾病，例如儿童缺乏钙、重度贫血、阻塞性黄疸，以及肝病、胆汁淤积等，也可能会导致孩子体内的碱性磷酸酶高，但这些原因比较罕见。
建议多让孩子到室外锻炼，多晒太阳，促进钙质的补充，尽量少到人群密集的场所，以免发生交叉传染。
儿童骨源性碱性磷酸酶为婴儿佝偻病检查指标。当孩子出现了这种疾病时，家长会发现宝宝的身体里有一种叫碱性磷酸酶的物质。医生抽血查婴儿血中骨源性碱性磷酸酶，可判定婴儿是否患佝偻病。有些孩子有一边肋骨凸起或者有点弯曲。因此，假如婴儿的两侧肋骨凸出，行走O型腿之类，可去查一查骨源性碱性磷酸酶，看有没有佝偻病，如果结果低于或等于200U/升，为正常。
