小儿夜间咳嗽可见于呼吸系统疾病和消化系统疾病，可见于支气管炎，咽喉炎，支气管肺炎，反流性食管炎等疾病有关。可能与炎症感染，反流的胃内容物刺激咽后壁，异物或刺激性气体吸入，气候改变等因素所致。
一般情况下，婴儿鼻炎每天凌晨三点咳嗽几声可能是以下原因引起的。具体分析如下：
小儿的鼻炎在凌晨出现咳嗽，很有可能是因为婴幼儿的过敏性鼻炎。也有一些原因是因为婴幼儿的急性鼻炎，这是因为病毒感染所致的鼻粘膜的急性炎性病变，会出现发热、鼻塞、流鼻涕等情况。当鼻液逆向流入咽喉时，会对咽喉粘膜造成一定的刺激，会导致咳嗽等。宝宝早上出现剧烈的咳嗽，也是因为孩子的胃内容物倒灌到了咽喉，会对咽喉粘膜造成一定的刺激。
一般情况下，宝宝咳嗽半夜发烧白天没事可能是由于呼吸道的炎症所致。具体分析如下：
孩子晚上会发烧，白天没什么问题，这是因为体内的荷尔蒙的水平和昼夜的周期不同。白天的时候，孩子的生理功能会快速的运行，到了夜晚，体内的荷尔蒙含量会降低，会出现发烧的情况。此外，夜晚的时候，孩子的大脑会进入一种睡眠模式，白天受到的短暂压制也会随之消失，孩子不但会发烧，还会发烧；其次，婴儿体内的水分含量要高于成年人，一旦脱水就会影响到人体的热量。夜晚婴儿的流入量相对较小，因此夜晚易于发烧；有的父母在睡觉之前就会让孩子摄入高卡路里的食品，例如奶类和其他的营养物质，这样孩子睡觉后会因为消化不了而产生大量的卡路里，从而导致发烧；另外，习惯于夜间为婴儿盖被子，也会导致散热降低；白天和晚上对宝宝的关心度不同，晚上会感觉孩子在发烧。
孩子半夜咳嗽有痰，说明孩子是感冒了，可以给孩子吃治疗感冒的药物，有痰需要再吃一些小儿化痰的药，痰液比较多时，可以配合着雾化吸入来稀释痰液。比较严重时就要去医院做相应检查。
宝宝夜间如果频繁或者剧烈咳嗽，刺激咽喉部，可以出现咳嗽后呕吐，需要让宝宝变换体位，防止引起吸入性肺炎。咳嗽后呕吐一般是由感染因素引起，比如细菌、病毒、肺炎支原体等。最关键的治疗是控制感染，才能治疗咳嗽症状，必要时需要去医院验血常规c反蛋白等检查，明确感染的类型，对症治疗。
孩子咳嗽时，膈肌收缩，胸腔内压力升高，挤压气道可以将痰液咳出，在痰液咳出，经过咽部时，咽部被刺激，引起恶心，强烈的食道、胃逆蠕动，就会引起呕吐，将食道、胃内食物吐出。
