进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
检查肠子做肠镜检查。
让肠子做检查，最直接的方式就是肠镜，由于现在的肠镜没有痛苦感，比较好的被病人所接受，包括一些不良的表现，如慢性痢疾、结肠炎、结肠炎，以便确定肠内的疾病，尽量做到早发现、早治疗。
消化道造影术可以检测到全部的消化道，但是很难发现细微的病灶。钡灌肠主要用于结、直肠以及腹部平片、小肠CT、核磁共振、胶囊内镜、小肠镜等，肠道的肿瘤标记物能够检测到肠道的肿瘤和病变。检查时要避免滥用药品，要根据具体情况选择不同的检测方法。
如果同房导致妊娠，可以在7-10天后用早孕试纸进行检测，也可以到医院采血检测HCG和孕酮，可以初步诊断妊娠。现在怀疑自己怀孕了，可以去药店买一个怀孕测试棒或早孕试纸来测试，以确定怀孕，月经推迟约10天前去医院做B超检查，以确定是否怀孕。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
狐臭如果说比较严重的情况下，自己都可以闻到，没有什么检查方法；如果比较轻微的，是可以不用治疗的，狐臭如果比较严重，可以用手术方法治疗，比较彻底，基本无复发。
