小儿阴茎短小需要考虑雄激素水平减低以及肥胖引起的假性隐形阴茎。阴茎的发育需要雄激素刺激，如果雄激素水平降低，可以导致阴茎发育迟缓短小等，需要做性激素测定。过度肥胖可以引起阴茎根部脂肪垫增厚，表现为阴茎短小，临床上称为假性隐匿性阴茎，需要控制体重。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
孩子阴茎本来就是很小的，而且大部分小孩子都比较胖，显得阴茎更小一些。现一般孩子到了青春期之后，第二性征会发育比较迅速，所以现在不用过分担心等孩子发育完成以后再说。
腹部左侧隐痛是比较常见的临床症状，要考虑来自胃肠道方面的疾病可能性大一些。如常见的慢性肠炎、直肠炎容易引起左侧腹部的隐痛。必要的时候还要排除有没有特殊的疾病，比如溃疡性结肠炎也可以出现左侧的隐痛，必要的时候可以做一下肠镜检查，排除有没有肠道方面的肿瘤性的病变，比如结肠癌直肠癌等。
对于6岁的孩子来说已经没有得到发育，所以阴茎短小是一种正常的现象，大多数的孩子在小的时候都会有包皮过长，当孩子10岁左右的时候仍然存在包皮过长，则需要进行手术治疗。
