小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
预防宝宝腹泻，平时要注意卫生。饭前、便后要洗手；注意饮食卫生，饮食要多样化，食品如有异样或异味应立即弃用，切不可食用。如果周围有腹泻的人，要尽量避免接触，并注意防护，以防被传染。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
如果腹泻与感染没有什么关系，而是考虑和食物的因素有关，是需要在食物方面做出调整的。饮食上，需要吃清淡的、容易消化的食物，并且遵从少食多餐的原则，让消化道得到充分的休息。
宝宝拉肚子时不建议吃东西，哺乳后可以继续哺乳，但要吃清淡的食物。六个月以内婴幼儿配方奶喂养，6个月后可以继续吃粥、面条、烂饭等清淡食物。进食量减少的情况下可以多喂孩子，尽量不要让孩子多吃含粗纤维的蔬菜、水果，也不要吃高糖、生冷的食物。在腹泻的时候，要注意给孩子补充营养，要注意逐渐增加营养，由稀到稠，由少到多，让孩子的肠道有一个适应的过程。
