跑步后膝关节疼痛可能是未热身、膝关节损伤等原因导致的，具体分析如下：
1.未热身：跑步后膝关节疼痛可能是未热身导致的，跑步运动锻炼前让关节适应性活动，包括髋关节，就是下肢热身让肌肉处于亚兴奋状态，然后再去跑步。
2.膝关节损伤：跑步后膝关节疼痛可能是膝关节损伤导致的，可能是因为长期运动性锻炼造成的膝关节的慢性运动性损伤，建议患者通过休息、局部热敷等方式缓解症状。
膝关节长骨刺可以用小针刀清除。膝关节长骨刺主要是由于运动过度引起的。可以通过佩戴护膝、中药外敷、服用抗骨质疏松的药物来进行治疗。骨刺在初期可以用小针刀进行清除，如果是骨质增生比较严重的，可以用关节镜进行清洗，关节镜无法清除的部分，可以通过外科切开来清除。在早期清除骨质增生后，需要服用药物，服用抗骨质增生药物。
膝关节疼痛不舒服，这个原因很多，也比较复杂，需要检查了确定，比较多见的原因比如半月板损伤，退行性变引起的骨关节炎，骨肿瘤，化脓性关节炎，关节结核，痛风，风湿等。这个可以考虑膝关节的地方拍片，另外就是磁共振检查，必要时可以考虑进一步检查血常规，血沉，C反应蛋白，尿酸等指标的，不同的原因治疗的方法不一样，如果是这个半月板损伤，局部可以热敷，贴膏药比如骨痛贴等，严重的三度损伤需要手术。
膝关节在下蹲的时候，因为关节对关节面的挤压特别厉害，所以这个时候关节内如果有组织有损伤就很容易发生疼痛。膝关节疼痛的原因比较多，可以到医院就诊，找清楚疼痛的来源，对症性的治疗。
骨刺其实也就是所谓的骨质增生，手关节出现长骨刺的症状人体衰老后导致的一种退化现象，患有这种症状后如果不是很严重的话，可以在医生的指导下服用消炎止痛的药物进行治疗，如果症状比较严重就必须采取手术的治疗方式了。
运动后膝关节疼痛可以口服非甾体类消炎镇痛药物。具体方法有：
1、单纯的锻炼后出现的疼痛，可以通过适当的休息来减轻。
2、局部肿胀，不影响日常生活和关节活动，局部可以通过冰敷等方式来减轻炎症，同时可以佩戴护具。
一旦发生了运动伤害，首先要做好充分的休息和保护，如果有红肿，可以进行冰敷，同时也可以使用活血化瘀的药物，但是局部有创面一定要避免外用，同时要注意是否有过敏反应，不能长期使用
