小孩生殖器囊肿通常是皮口或尿道外口。
包皮口囊肿在包皮交界处，治疗以手术切除为主，若包皮囊肿较大，建议进行包皮环切。若囊肿在尿道外口，建议进行囊肿剪开或剥离，创面要垫住缝合。囊肿具体病因不明，是一种良性病变，切除后没有不良的反应，术后要留置尿管预防，预防切口感染，感染会难以愈合，容易形成瘢痕。也可以选择注射治疗，生殖器部位不建议用注射治疗，防止不良反应。通常囊肿不会很大，早期可以观察，多数预后良好。
一般来说，小孩鼻囊肿根据实际情况来处理。具体分析如下：
小孩鼻囊肿有很多种类型，通常不是很大，可以先观察，然后再进行保守疗法，同时要做好鼻子内部的卫生，并定时进行检查，一般都能自己消化，但若囊肿继续扩大，或是出现了大量的破裂，则必须进行外科治疗。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静和室内空气新鲜，应该多吃含钙丰富的食物，如奶制品、豆类、豆制品等，适当运动。
鼻囊肿，大多是炎症引起的。由于鼻腔部位的炎症的慢性刺激，所以导致囊肿的发生。如果囊肿体积不大，可以考虑口服消炎药。反之，如果囊肿体积大，也只好考虑进行手术切除了。
粘液腺囊肿主要是由于导管阻塞而形成潴留性囊肿，需要及时的去正规的医院口腔科进行手术切除，然后做组织病理学检查粘液腺囊肿是不会自愈的。建议平时养成良好的饮食卫生习惯，多吃蔬菜水果，补充维生素，提高免疫力，可以减少口腔内感染的发生。
肝囊肿是否会生长是不可预测的。只能通过一次又一次的观察来判断。如果病人的囊肿没有生长，也没有给病人带来不适，那么就不需要治疗，继续观察是好的。如果有增长的迹象，那么就需要手术。必要时可以考虑局部切除肝脏组织。
发生于小孩子身上的腱鞘囊肿比较少见，是否严重需根据囊肿大小判断，具体内容如下：
腱鞘囊肿是一种良性病变，其主要影响在于影响美观，包块增大压迫周围组织和神经时表现为轻度的胀痛，但仍有一定恶变的风险。如果小孩子腱鞘囊肿较小，没有明显的不适症状，也未影响关节的活动，一般不严重，可以不做任何处理。但如果囊肿较大，或有严重的疼痛症状导致活动受限，一般比较严重，可以进行手术治疗切除囊肿，一般对生活没有太大影响。
