通常来说，孩子持续发热39度3天的原因，具体分析如下：
孩子持续发热39度3天，可能与细菌、病毒等因素有关。建议及时到正规的医院看小儿，做血常规、C-反应蛋白等检查，明确引起高烧的原因，然后进行药物的治疗。平时多给孩子多饮水，可以选择适当的物理降温，也可以通过口服药物降温。高热退烧，防止感冒，要多给孩子多饮水。
家长应该让孩子注意休息，保持营养均衡，早睡早起，同时适当带其到户外活动、呼吸新鲜空气，有助于身体健康。
可能是由细菌或者病毒感染，导致体内有炎症所引起，治疗方面需要积极的抗炎、抗感染治疗。如果单纯的用退烧药退热治疗，是治标不治本的，只能够暂时退烧，还容易反复发烧。用温水擦浴、贴退热贴等物理降温的办法治疗即可，不用吃退烧药物。
通常情况下，儿童持续发热的原因有很多。
一般认为是因为疾病的原因，或是使用不当的药物，导致感染，没有得到有效的控制。还有就是患者的情况比较严重，还有一些原因没有被及时的诊断出来。许多慢性疾病在初期会先发烧，然后会慢慢的表现出来，包括各种传染性疾病，例如：结核病、布氏杆菌、支原体等。像是川崎病、风湿、血液等免疫系统的病症，都是要慢慢地进行检测和确诊的。
孩子如果出现了单纯的发烧，很有可能是因为上呼吸道感染所引起的属于是感冒的早期的一些现象。
宝宝对各种病症的抗性比较弱，发烧是多种病症的一种表征，并不是病症的具体表现。不过，父母要知道，孩子的发烧并不代表他的病情很重，有些情况下，孩子的情况并不会很糟糕。引起宝宝体温升高的因素有很多，其中一些是因为系统的疾病引起的。
宝宝出现单纯的发烧可能是由于某些病原体感染的前期，或者是某些特殊部位的感染，或者是外界环境温度过高。
当婴儿感染细菌或病毒后，早期仅会出现发热，没有其他明显的临床表现；当宝宝出现某些特殊部位感染时，会出现发热，其他症状不易察觉。如果出现上述情况，建议去医院做血常规检查，检查C反应蛋白检查是否感染。如果确定宝宝感染了，应进一步确定病原体类型，并使用敏感药物。
小婴儿的体温调节功能还不完善，如果外界温度过高，或者穿了太多的衣服，宝宝的体温可能会升高，这时候应该给宝宝减去衣服，喝水观察体温变化。
宝宝长牙发烧属于生理性发热，也可能是感染导致的。
宝宝长牙发烧与体质有关系，也不排除是因为并发感染而导致。这时候要提高免疫力进行去毒化积的方法治疗，建议先进行物理降温，用温热的毛巾擦试宝宝的额头、颈部、腋窝、腹股沟等部位，如果宝宝高烧到39度甚至40度，就应该及时到当地医院就诊，在医生的指导下治疗。
