下丘脑性闭经是由下丘脑各种功能和器质性疾病引起的闭经。此类闭经的表现是下丘脑合成和分泌促性腺激素释放激素缺陷或不足导致垂体促性腺激素，即卵泡刺激素和黄体生成素特别是LH的分泌功能低下，故属于低促性腺激素、低雌激素性闭经。
闭经有可能会是内分泌失调或者卵巢早衰引起的，不管是内分泌失调还是卵巢早衰，其治疗方法都是以雌孕激素调理为主，中医治疗为辅！但若能正确面对，注意精神、运动、压力、饮食，配合中西医结合调理会安全渡过此阶段。
有可能与内分泌失调有关，有可能是多囊卵巢综合征等引起的，也不能排除子宫发育异常，去正规的医院做彩超，化验激素六项，甲状腺功能等，查清原因再治疗。如果是多囊卵巢综合征引起的，需要控制饮食，多锻炼。
病因治疗，找到引起闭经的器质性疾病给以恰当治疗。例如结核性子宫内膜炎即给抗痨治疗。性激素替代疗法，对先天性卵巢发育不良，或卵巢功能受损或破坏以致早衰者可用激素替代疗法。
刚刚发生绝经的时候治疗是比较好的，可采用饮食疗法、药物疗法等。找出引起闭经的疾病，对症治疗，如结核性子宫内膜炎给予抗痨治疗；宫腔粘连扩张宫腔并放置节育环，以防再次粘连；垂体、卵巢肿瘤可行手术。
