可能是缺乏微量元素钙，可以适当地补点，以及多晒太阳有利于维生素的吸收。也有可能是睡觉的生物钟紊乱，可以适当地调整孩子的睡眠习惯等就可以逐渐的改善了。
凌晨3点就醒可能是生物钟紊乱所引起的。或者是心肌缺血，睡觉的前半段主要是大脑皮层的抑制，身体的疲劳和习惯而入眠，而下半夜由于身体处于休息状态，全身机能活动减少。
一般情况下，如果是在凌晨四五点胃难受的话，可以进行顺向的按摩，同时要做好肚子的保暖工作。
还可以用温水泡脚，也可以用热毛巾热敷一下腹部，促进肠胃的血液流通，减轻疼痛。多适量一些碱性的食品，比如包子、糕点、牛奶等。能够中和胃酸，起到缓解的效果。去药房买一些药物。日常生活中要保持好的饮食和生活方式，并且要有规律的三顿饭。每天都要有一个好的情绪。
考虑气道有不同程度的炎症反应。气道有炎性物质分泌物的刺激，可能气道还存在有狭窄，也可能与支气管平滑肌的收缩和痉挛有关。另外就是受到了支原体、衣原体的感染。
平时要保持睡眠环境舒适，安静，加强营养补充，及时进行补钙。因为儿童总是夜间睡眠时出现哭闹，可能与受到异常声、光等强烈刺激，引起神经功能异常有关。也可能与内环境平衡紊乱，引起神经兴奋性增强有关，多见于钙缺乏，会伴有睡眠不实，出汗多等表现。
小儿凌晨四五点咳嗽可能因感冒鼻涕过多，平躺倒流刺激咽后壁引起，也可能是支气管炎或咽炎引起的，可以到医院查血常规、胸部X线以明确诊断，咳嗽是一种反射性的保护动作，当呼吸道内有异物或分泌物时，通过咳嗽咳痰可将其排出。
