新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
卡介苗和乙肝疫苗可以一起打。
卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗。卡介苗可与乙肝疫苗同时接种，不影响彼此效果，并能改善乙肝表面抗原阳性，但应分别向左，右两侧臂进行接种。接种24小时之内切忌沐浴，注意观察皮肤的表面状况及接种后的进食和排便情况、睡着了等，如果不舒服，要与接种机构取得联系，及时咨询医生。
乙肝疫苗和卡介苗能分开打，不在同一个胳膊。一定要分开手臂进行接种，通常是乙肝疫苗接种在右手，另一个接种左手，如果由于某些原因没能接种，乙肝疫苗接种在先，那就2周后再接种；如果后一个接种在先，那要1个月后再接种乙肝疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
为了有效的预防乙肝病毒的传染，乙肝疫苗的免疫接种纳入基础的接种范围以内，孩子出生以后，按照0-1-6月份的时间进行正规的疫苗接种。新生儿的母亲是乙肝病毒感染者，尤其是大三阳的患者，孩子出生以后，除了正规进行疫苗的接种，还需要使用乙肝高效价免疫球蛋白，一般在出生后24小时内尽早使用，然后在半个月以及一个月的时候，分别再次使用，可以有效的预防乙肝病毒的垂直传染的发生。
卡介苗和乙肝第二针可以一起打。
我国计划免疫规定胎龄≥37周,出生体重≥2500g的新生儿,出生后要接种卡介苗。接种有胎龄和体重限制,胎龄和体重都不达标建议延迟接种。通常3个月内的卡介苗可以直接接种。月龄3个月到3岁,要做PPD试验,阴性才能补种。乙肝疫苗通常是出生后打的第一针,1个月时打一针,6个月时打第二针。出生时卡介苗和乙肝疫苗可以同时接种,若出生时没有接种卡介苗,1个月时可以和乙肝疫苗一起接种。同时接种卡介苗和乙肝疫苗不会降低免疫效果,同时接种有助于提高乙肝病毒阳性母亲生下的新生儿接种卡介苗的效果。
