巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
卵巢囊肿手术一般是剔除卵巢囊肿的，卵巢是不会切除的，剔除囊肿对生育是没有影响的了，如果切除了卵巢，那么还有另外一侧的卵巢的了，也是可以怀孕的了，只不过怀孕的几率是正常的一半的了。
通常情况下，巧克力卵巢囊肿是子宫内膜异位症。
是指子宫内膜与卵巢发生异位所引起的一种囊肿。子宫腔内的内膜剥脱后呈暗红色，像是巧克力，这种情况出现在卵巢上，称为巧克力状卵巢囊肿。巧克力卵巢囊肿属于双侧，女性在月经期间会有左右下腹疼痛，这是痛经的症状。如果卵巢巧克力囊肿比较小，疼痛比较轻微，可以通过适当的镇痛来减轻；如果是巧克力性卵巢囊肿比较大，可能会出现蒂扭转，但术后很可能会出现复发。
巧克力囊肿会引起女性小腹疼痛，痛经，性生活疼痛，阴道内不规则出血，盆腔器官黏连。输卵管阻塞，影响受孕几率，如果长期没有得到有效治疗，会引起女性贫血。巧克力卵巢囊肿属于子宫内膜异位，而子宫内膜异位是导致不孕的重要原因之一。
卵巢囊肿的检查需要医生指导下的药物控制，平时应注意定期复查。如果文窝囊肿超过5厘米，就去医院做手术。治疗卵巢囊肿时避免进食。平时，不吃辛辣食物，也不吃海鲜饮食，避免吃发制品，以免加重刺激。
腹腔镜卵巢囊肿手术至少休息一个月，通常6-8周后可完全恢复正常，但是卵巢囊肿手术后的恢复还要取决于个人的综合体质，多注意休息，饮食要清淡，避免吸烟和饮酒刺激食物，多吃一些蔬菜和水果，恢复期间禁止同房，注意个人清洁卫生，保持愉快的心情。
