通常情况下，肾结石如果治疗不及时不彻底会引起肾萎缩。
肾结石假如医治不立即完全，不消除对肾脏的进行性损害，就会造成肾脏萎缩状况。大部分结石患者可以根据系统正规的检查治疗，但一部分患者并没有显著的临床表现，或者没有发现结石，或是发觉肾结石后没完成相对应的医治。肾结石进行性的发展可引起肾脏的积水。伴随肾脏萎缩、肾功能阻碍、比较严重的患者会造成肾功能缺失。
高血压会引起肾萎缩。
高血压的一种病理变化是异常血管平滑肌变厚，血管壁玻璃样变，特别是入球小动脉玻璃样变，管腔进行性收缩会对肾小体灌注造成一定的影响。有间质淋巴细胞浸润的肾小球玻璃样变。炎症的吸收往往会被纤维结缔组织所替代，最终导致肾脏细胞的数量不断下降，最终被纤维结缔组织所替代。肾萎缩主要是由于肾脏的体积变小，表面呈现颗粒状，肾脏周围的脂肪组织也会增加。
一般情况下，肾结石合并肾萎缩比较严重。具体情况分析如下：
萎缩侧肾功能一般不会影响正常生活。肾结石合并肾萎缩的情况比较少见，主要是由于长期结石梗阻导致肾脏严重积水，肾脏皮质菲薄，解除梗阻后肾脏积水排出，肾脏体积会变小，出现这种情况是无法改变的，肾脏功能受损是不可逆的。注意保护对侧肾脏功能，定期进行泌尿系彩超、肾功能检查，及时发现新情况及时处理，以免损伤健侧肾脏功能。
肾结石会不会引起肾萎缩，要看患者的情况。
肾结石在早期就被诊断出来，经过及时的处理，基本上不会对肾造成太大的伤害，也不会造成肾萎缩。肾结石是一种常见的疾病，一旦发现不及时治疗，造成阻塞，在晚期就会发生肾萎缩，这是由于肾结石堵塞，会造成肾水肿，肾水肿的程度会加重，从而造成肾组织的收缩。
因此，对于肾结石患者，要尽早进行有效的处理。
如果是一边的肾脏萎缩，另外一边的肾脏出现结石，一定要注意，首先应该到正规的医院做进一步的检测，看看肾脏的情况。还需对肾结石进行积极的处理，要尽早将其排泄出来，避免出现结石堵塞，对肾功能造成损伤。由于肾萎缩可能会导致肾的机能下降，一些患者出现了肾萎缩，可能会导致肾功能完全消失，所以要注意对患有结石的肾进行一定的防护，尽早将其排除，避免发生更大的问题。
肾动脉狭窄导致肾缩小，通常情况下很难扭转。
所谓肾萎缩，其实就是肾脏内部分组织被破坏，坏死了，以此为基础将纤维瘢痕组织代替原肾组织，因纤维瘢痕组织体积较肾脏实质之间显着缩小，因此肾脏呈现萎缩和体积减小的特征。肾动脉狭窄可导致肾萎缩，其实，有许多原因，如损伤肾脏，均有肾脏萎缩的表现，无论何种病因引起肾萎缩，一般不可逆转。由于肾的组织是不能再生的，因此，肾动脉狭窄导致肾萎缩，已缩小了的地方就再也无法复原了。治疗旨在推迟其余健康组织继续受损，控制肾动脉狭窄所致的有关并发症。