肝功能异常的原因很多，最常见的是病毒性肝炎（甲、乙、丙、戊型肝炎病毒），长期大量饮酒，导致酒精性肝炎，近期有用药史，导致药物性肝炎，自身免疫性肝炎，肥胖脂肪肝等。需要进一步查相关指标，找出病因，对症下药。
肝功能异常是指肝脏收到某些致病因素时，肝脏功能发生异常和肝脏组织收到破坏的一种临床表现。其发生原因有化学中毒，会影响机体正常的代谢，对肝脏细胞造成损伤而导致功能异常。感染，如病毒、细菌、寄生虫，临床多见病毒性肝炎导致的肝脏功能异常。肿瘤疾病，侵犯肝脏组织而成。4.胆道系统疾病，胆道结石或胆道炎症等疾病也会影响胆汁代谢，进而影响肝脏功能。
怀孕期间若肝功能轻度异常，可能与妊娠期生理反应、肝脏负担加重、休息不足、身体劳累等因素有关。而肝功能严重异常则可能是患有肝硬化、病毒性肝炎、胆汁淤积症引起的肝损伤。
因此，需要根据肝功能异常的轻重程度，及导致肝功能异常的具体原因，采取不同的措施。若怀孕期间肝功能轻度异常，可做注意休息，避免劳累，若孕期转氨酶升高没有超过正常值两倍以上，通常不需要特殊的处理。如肝功能严重异常，转氨酶显著升高，则需要在医生的指导下进行保肝降酶的治疗，合理用药，避免影响胎儿健康发育。
脂肪肝肝功能异常可以通过饮食结构的调整和适当的运动来达到缓解的目的。如避免饮酒和进食高脂油腻，高糖等高热量的食物，适当地进行游泳，慢跑。如果肝功能异常的指标非常的明显，还应当及时给予药物进行治疗。
肝功能不正常就是肝功能有新问题。可能与肝脏本身有问题有关系的，比如其他的病毒性肝炎或是大量总是饮酒和休息不好，都有关系的。所以要找到因素针对因素治疗才行的。肝功能轻度不正常病人要先到医院进行检查，看是什么因素造成的肝功能不正常，再根据病因来对症下药，平时一定要注意不要过于劳累，禁酒，不要吃肝损害的药物。多喝水多吃蔬菜水果。
脂肪肝引起肝功能异常可以通过以下几种方式治疗：
1.一般治疗:限制机体热量摄入,以控制体重,对饮食结构进行调整,少吃高脂、油炸的食物,多吃粗粮、蔬菜等。
2.药物治疗:可在医生指导下使用复方甘草酸苷片、还原型谷胱甘肽等药物进行保肝治疗。
3.手术治疗:如果脂肪肝患者肝功能异常,使用以上药物治疗无效,病情持续发展,导致肝硬化、肝脏衰竭,可考虑通过肝脏移植手术进行治疗。
患者需要注意的是，营养不良引起的要注意加强营养。过度节食引起的停止节食注意均衡营养。糖尿病引起的要控制血糖等。
