脑部核磁共振不能查脑供血不足，可以通过脑部核磁共振观察颅内血管走形及各级分支，观察血管有无畸形，有无狭窄，闭塞等。脑供血不足，需做个脑血管造影才能明确的。
脑部ct能观察脑内出血，梗塞，肿瘤，骨折，尤其是颅内的钙化。脑部核磁共振对早期脑梗塞观察比脑部ct要早。对于脑部病变，脑部核磁共振优于脑部ct。脑部核磁共振不用打造影剂，可以进行脑血管成像，对脑内神经病变显示比ct更清楚，更明确。而且核磁共振没有辐射损伤，这一点明显优于ct。因此脑部疾病检查尽量选择核磁共振。
进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
一般情况下，核磁共振是神经外科最常用的技术之一，应用于大脑病变患者，甚至是癫痫症患者。MRI可以检测到脑部的组织是否有任何的问题，比如肿瘤、出血、创伤、脑组织的畸形等。而且，清晰度更高，甚至可以通过谐波检测，观察到微小的损伤。CT会产生一些放射性物质，对于一些孕妇和即将受孕的女性来说，最好不要接触。而核磁共振成像则比较无放射性，因而更为保险。
大致都在2个小时左右可以拿结果，但在个别情况下可能会迟些。例如疑难病症，不能做出明确诊断，需要进行必要鉴别诊断和病例讨论，因此出具报告的时间会长些，可能会在第2天取报告。
