支原体、衣原体等是轻度或中度的，自身的免疫功能是可以自行恢复的。支原体、衣原体感染、自身免疫力低下等情况，是很难治愈的。
对于支原体、衣原体的治疗，可以选择红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等三种药物。近年来，对支原体的抗药性越来越强。抗药性高达75%，使用红霉素类的药物也不一定有效。如果治疗无效，可以选择环丙沙星、左氧氟沙星等喹诺酮类药物。另外，四环素、多西环素、米诺环素等都是四环素。
支原体衣原体感染的严重程度，取决于它所引起的何种结果。
第一，造成不适，如支原体，衣原体尿道感染等，会引起尿痛或者尿道刺痛。支原体衣原体感染前列腺，就是前列腺炎，会导致尿频，尿急等不舒服。支原体衣原体感染精囊或生殖系统，会造成受孕困难。
因此支原体衣原体的感染严没有严重，需要对病症进行鉴别。
通常情况下，婴儿肺炎住院会交叉感染。具体情况分析如下：
肺炎是发生于终末气道、肺泡和肺间质的炎症，常见的症状有咳痰、咳嗽、发热等，肺炎是呼吸道传染病，可以通过飞沫传播，因此婴儿肺炎住院会交叉感染。由于婴儿已经是肺炎患者，不怕再被传染。家长可以在医生的指导下给婴儿使用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊、利巴韦林片等药物来治疗。
衣原体支原体感染可能会自愈，但可能性比较小。
衣原体和支原体是比较常见的微生物，身体免疫力低下可能会造成感染的情况。患者的病情非常轻微时，可能会存在自愈的情况。但是，患者的自愈可能性是比较低的，建议患者及时前往正规医院，遵医嘱使用合适的抗生素进行治疗。
支原体衣原体感染会影响怀孕：
泌尿生殖道感染支原体后，引起的疾病男性为非淋菌性尿道炎，表现为尿道刺痒、烧灼感和排尿困难，少数有尿频。尿道口轻度红肿，分泌物稀薄，部分病人无症状。女性主要为非淋菌泌尿生殖道炎，表现为白带增多，尿道灼热或引起盆腔炎，输卵管炎等而引起不孕，流产和宫外孕.所以如果发现有此问题，最好是在医生的指导下进行有效的治疗。
支原体和衣原体是两种不同类型的病原体，部分患者感染后表现为肺炎。临床主要表现为发烧、厌食、咳嗽、畏寒、头疼、胸骨疼痛等，如果是因为支原体感染而造成的。可以口服头孢菌素、青霉素等，这些都是对细菌敏感的抗生素，在医生的指导下使用后有利于缓解患者出现的临床症状。
