一般情况下，药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的，属于正常的反应。
清宫手术的疼痛感主要是清宫时扩张宫腔带来的，在医疗器械进入宫腔内的刮宫过程也会疼痛，因此药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的。在采用无痛的清宫手术后，麻药药效过后，也会有轻微的疼痛感，但是一般在可以承受的范围内。
日常生活中女性要注意多休息，坚持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激的食物，有利于病情的恢复。
一般情况下，药物流产不干净不清宫会导致贫血、盆腔炎等问题。
药物流产如果不干净，检查发现有宫腔残留组织，一般需要尽快进行清宫处理，否则容易导致贫血、盆腔炎、子宫内膜炎等情况，严重时残留组织还可能会发生机化，进而对以后正常的月经来潮和生育造成不良影响。所以一旦出现药物流产不干净的情况，患者需要听从主治医生的建议，尽快进行清宫。
普通的清宫手术，一般术后休息两周即可恢复正常的工作和生活。清宫手术适用于不全流产或者宫腔的异常回声、子宫内膜增厚等，也适用于其他流产方式流产不完全的补救措施。它是一种有创的操作，需要在宫颈扩张的前提下将宫腔内的残留物吸出，所以会对子宫以及内膜、宫颈和内分泌组织都造成一定的损伤。术后还会有一段时间出现阴道流血，所以术后应该休息一到两周。
一般情况下，药物流产不干净的几率大约在30%-40%。
药物流产主要是通过服用药物来胚胎凋亡，从而促进子宫收缩，将宫腔里的妊娠物组织排出体外。在这个过程中，女性对药流药物的敏感性比较重要。如果女性对药物敏感，一般情况下，都能药物流产成功；如果女性对于药物不敏感，有一定的可能出现药流不全、药流失败等情况，如果女性出现这些情况，建议及时去医院通过清宫术将残留的妊娠物组织排出体外。
一般情况下，如果孕囊比较大或女性子宫收缩乏力，可能导致药物流产流不干净。
通常，药物流产在3天的时间里吃米非司酮片以及米索前列醇片来终止妊娠。如果孕囊比较大、女性子宫收缩乏力，有一定的可能导致药物流产流不干净。服用药物后，女性需要再配合生化颗粒、益母草颗粒等活血祛瘀的药物进行调经处理，从而促进宫腔妊娠物排干净。在药物流产后的两周应该复查B超，如果宫腔残留物比较多，需要尽早清宫处理。
一般情况下，药物流产不干净的表现有发热、腹部疼痛、阴道流血等。
药物流产不干净通常会出现发热的现象，可能是药物流产不干净导致的宫内感染，这种情况下应及时去医院进行B型超声波检查，如果有宫内残留物，应及时在医生的指导下进行刮宫处理。此外，药物流产不干净还会有腹部疼痛的表现，通常为持续性的腹痛、压痛等症状。阴道流血也是药物流产不干净的表现，流血时间较长，流血量比较大，这种情况下一般也代表子宫内有残留物。