进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
胃镜检查时，医生右手持镜前段将胃镜放入舌根部，此时病人进行吞咽动作，将胃镜送入食道，而后继续向下送镜子观察胃及十二指肠情况。肠镜是利用一条装有微型摄影机的纤维软管进行检查，其由肛门进入肠道，顺势观察肠腔情况。
胃肠镜检查是有必要的。
一般情况下，从40岁开始就可以通过胃肠镜对早癌进行筛查，有时候患者身体较好，且没有的特异症状，但是癌症或癌前病变已经出现，所以，进行胃肠镜检查是很有必要的，能够起到早发现、早诊断、早治疗的效果，能及时阻断癌变过程，达到预防癌症的效果。
在日常生活中，还需饮食清淡，作息规律，适当运动，可以缓解身体不适，促进身体健康。
可用于检测不明原因的消化道出血、慢性腹泻、低位肠梗阻、大肠肿瘤、息肉等。其检查内容包括肛管、直肠、乙状结肠、结肠回盲部等部位，且可以进行活体的病理学和细胞学检查。
结肠镜可以由肛门插入，直到盲肠端，可以观察盲肠，升结肠，横结肠，降结肠，乙状结肠，以及直肠的内壁情况，结肠镜是诊断结肠疾病的重要手段，同时也可以对结肠内的疾病进行组织活检或者治疗。检查是一次性的，并非分段多次，少数可能因为个体肠道异常或检查医生技术问题不能够检查到全结肠。
如果去正规医院检查肠镜，是不会感染艾滋病的。正规医院在检查肠镜之前需要对检查者做身体检查，包括艾滋病的检查，但不排除有些艾滋病感染可能处于窗口期，所以做完肠镜检查之后，会对肠镜进行彻底消毒，包括对于艾滋病病毒的一个针对性消灭，防止肠镜有窗口期感染的艾滋病病毒存在，所以在正规医院检查肠镜时是不会感染艾滋病的，但如果去一些非正规医院检查肠镜，消毒环节，以及检查环节，可能不够严谨，就有可能感染艾滋病。
