小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
感染性原因：需考虑是否是秋季腹泻、轮状病毒或新病毒感染引起，细菌性原因：如细菌性痢疾感染，包括伤寒、沙门菌感染等。过敏性因素：如对奶粉蛋白质过敏，会表现为腹泻，伴有湿疹的情况。如给予止泻处理，腹泻症状改善不明显，需进行过敏检测。
大便次数增多，呕吐，腹痛腹泻的症状，和消化不良有关系。给宝宝做腹部热敷腰，饮食上要均衡营养，规律的进食，不要暴饮暴食，不要喝饮料，不要吃膨化食品，可以去儿科就诊，做一个大便常规检查，看一下由引起。
新生儿如果出现腹胀，同时又拉肚子，家长朋友直接带着宝宝到医院找专科的医生进行治疗。因为在宝宝出现腹胀的情况下，如果同时合并腹泻，我们可能考虑这个宝宝存在肠炎。对于新生儿来说，他的肠道非常薄且娇嫩，如果出现肠炎，病情进展较快，有时过久的观察或者在家里治疗起不到作用，反而会耽误宝宝的治疗。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
