肛瘘术后一般七天左右就可以出院，伤口完全愈合需要一个月左右，但是七天后就没有什么症状了，可以正常上班工作，不做重体力活就可以，出院后需要隔天去医院换药，肛瘘术后需要坚持每天肛门坐浴，定期换药。
一般手术的时间在二十分钟以内可以完成，术后的恢复时间快，切口的愈合时间短。高位肛瘘或者复杂性肛瘘，因为瘘管位置偏高，而且瘘管不止一根，走行相对复杂，在术中医生需要仔细探查瘘管，防止因为瘘管或者内口遗漏而导致术后的复发，时间相对长一点，有可能半个小时到一个小时不等。
肛瘘手术以后，如果没有任何其他的特殊症状，是可以适当下来活动了，平常要注意局部的卫生，要加强换药，同时要注意加强营养物质，要养成每天排便一次的习惯，避免出现便秘。
肛瘘手术后要注意饮食宜清淡，少食辛辣、煎炒、油炸、烈酒等不消化和刺激性食物，多食水果、蔬菜和纤维性食物，多饮水，尤其是香蕉、苹果，蜂蜜类润肠通便食物，一个月就可以恢复了。
肛瘘手术后，如果没有继发细菌感染，正常生理功能可在半个月至一个月左右完全恢复。手术后，应多吃苹果、香蕉、绿豆牙、冬瓜、黄瓜、苦瓜、芹菜、菠菜、韭菜等粗纤维食品，以促进胃肠蠕动，保持排便通畅。
