如果有扁平疣，可通过以下药物治疗：
1.可以服用重组人干扰素α-2b凝胶、咪喹莫特软膏等调整免疫力的药物；
2.还可以选择维A酸乳膏、他扎罗丁凝胶、阿达帕林凝胶等维甲酸类的药物。外用药渗透性、吸收性都比较差，而且皮损比较多；
3.可以通过激光、电灼等物理疗法来进行；
4.免疫功能低下的人容易得扁平疣，所以可以服用一些可以提高免疫力的药物，例如转移因子胶囊。
扁平疣是由人类乳头瘤病毒引起的，大部分都是骤然出现，通常为针头至米粒大或稍大的扁平丘疹，呈圆形或不规则形，略高于皮肤表面，也可显著地凸起而形成圆顶状.表面光滑，境界清楚，触之较硬，为浅褐或灰白，淡黄或正常皮色.大部分散存在或密集成群。
一般来讲，眼睛上长的是扁平疣，通常是长在上眼睑和眼角，结膜上不会有扁平疣。这位扁平疣的初期疣体较小，可用抗病毒药物或局部涂擦阿昔洛韦。通常在治疗半个月后，疣体就会自动脱落。有些病人可以在不需要任何治疗的情况下自行恢复。如果身体太大会影响美观，可以选择激光手术或外科切除。扁平疣是由人乳头状瘤病毒感染引起的。
引起疾病的病因主要是由于没有注意清洁卫生造成的病毒感染。所以需要注意局部皮肤的清洁，不要去搔抓局部的皮肤，同时采取冷冻切除治疗。
脸部扁平疣用水杨酸软膏、维A酸软膏、咪喹莫特软膏、氟尿嘧啶软膏等可以去除。
扁平疣是由人乳头瘤病毒感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物，多发生在面部、手背及前臂等，主要表现为扁平小丘疹，一般没有自觉症状。如果患者出现瘙痒症状，可以遵医嘱使用水杨酸软膏、维A酸软膏、咪喹莫特软膏、氟尿嘧啶软膏等药物治疗。
