如果怀孕才一个月，现在有腹痛，腰疼及少量褐色分泌物，是少量出血的表现，现在是先兆流产的情况。首先需要抽血化验hcg及孕酮看一看怀孕以后的激素水平是否正常，再就是检查超声看一看是否是宫内怀孕，及怀孕的情况，再根据检查保胎治疗，同时卧床休息。
一般情况下，肚子疼、腰酸可能不是怀孕了。具体分析如下：
肚子疼、腰酸等都不是怀孕特有的症状，女性在来例假之前要注意检查自己的经期，如果有孕后一星期要做尿检，确定是否有孕。如果女性出现肚子疼、腰酸等情况，可能不是怀孕了，可以去医院检查一下，确定是不是因为附件感染引起的。附件感染可以通过热敷下腹部来改善盆腔的血液流通。
一般来说，怀孕两个月肚子疼腰酸主要是以下原因。具体分析如下：
怀孕两个月肚子疼腰酸，考虑这是一种正常的早孕反应，主要是怀孕后受到体内的激素分泌引起的的变化，若无其他不适症状，一般是正常的生理现象，无需特殊治疗，适当休息有助于缓解相关症状。此外，也有可能这是由于怀孕之后，子宫逐渐增大，从而对局部的肌肉组织造成一定压迫而引起的表现，可以适当的采用侧卧位，或者用毛巾热敷来帮助缓解不适症状。
需要注意的是，怀孕期间建议合理膳食，尽量以清淡为主，少吃辛辣刺激性食物。
宫外孕需要去医院检查确诊，宫外孕常见症状是下腹坠痛，有排便感，有时呈剧痛，伴有冷汗淋漓。破裂时病人突感一侧下腹撕裂样疼痛，急性出血，常伴恶心呕吐。宫外孕的治疗原则以手术治疗为主。
怀孕早期肚子疼有褐色分泌物需要到正规的医院做相应的检查，在医生的指导下对症处理，避免造成严重的危害。这期间注意多喝温开水，多吃容易消化吸收的食物，不可以吃辛辣刺激性的食物。
考虑是先兆流产的可能性比较大。如果现在是停经40天左右，平时月经规则，1个月来1次月经，首先要去医院查妇科彩超，看胚胎的发育情况。如果彩超提示宫腔内孕囊回声，有褐色分泌物，并且出现腰酸，如果打算要宝宝，要给予药物保胎治疗。