腰穿检查方法主要是可以取脑脊液检查，测量脑脊液的压力，可以取出脑脊液进行成分检查，如脑脊液蛋白高不高，糖低不低，细胞数是不是正常，现阶段有很多自身免疫性抗体检查也可以检测。
检查一上午就可以结束，腰穿检查主要测脑脊液的压力、脑脊液性状以及脑脊液里的细胞数，多用于检查感染性疾病、自身免疫性疾病以及脑出血的脑脊液压力，脑脊液压力可以通过腰穿测得，脑脊液的细胞数，可以进行脑膜炎、细菌性脑膜炎、病毒性脑膜炎这些感染性疾病的鉴别诊断，同时还可以做球蛋白自身免疫疾病检查。
做腰穿检查能确诊很多疾病，比如中枢神经系统炎症，包括这种化脓性脑膜炎，还有结核性脑膜炎和病毒性脑膜炎，乙型脑炎等疾病。同时也可以检查颅内压是否增高，或者是颅后窝是否有占位性病变的现象，如果长期处于休克或者是身体衰竭的状态，也可以做腰穿。
临床上白血病的诊断和治疗都必须进行腰椎穿刺，以便于判断有没有合并中枢神经系统白血病，即使没有，在化疗的同时，也可能要定期做腰穿加鞘内注射化疗药物，来预防中枢神经白血病。根据病情的严重性，酌情增加腰穿次数，增加鞘内注射的次数来治疗脑白。腰穿操作属于有创操作，它对人体会存在一定的危害。但是绝大多数这种操作带来的损伤，都在可控范围内。
当发现皮肤上出现异常，有着鳞屑但又不能确定是不是鱼鳞病时，可以到正规医院皮肤科做这些检查：皮肤组织病理检查、免疫荧光检查、基因组DNA诊断等，都是可以有效诊断的。
