一般情况下，性功能障碍的治疗要根据病因来进行治疗。如果是心理上的原因，比如性生活时由于心理紧张导致阳痿早泄，导致阳痿早泄，要注意精神放松，必要时可以找医生进行心理疏导和心理咨询治疗。还可以在医生的指导下服用镇静安神的药物。如果阴茎海绵体供血不足导致血脂升高动脉硬化，出现性功能障碍时，应积极治疗原发病，同时要注意低脂饮食和降血脂的药物。
分离性障碍的治疗包括：心理治疗，比如暗示疗法是分离性障碍的经典方法，适用于急性发作而暗示性又较高的患者，临床上常用的有觉醒时暗示、催眠暗示、诱导疗法等。另外还有系统脱敏疗法、个别心理治疗、分析性心理治疗、家庭疗法等；药物治疗，分离性障碍还没有特效的药物，主要是对症治疗。
男性功能障碍，可以用下面方法治疗：首先应明确患者性功能障碍的原因，若为性知识缺乏而导致的障碍，可对其进行性生活知识的宣传教育；针对工作、生活压力大的性功能障碍者，可进行心理干预，消除日常的紧张、焦虑情绪；另外，建议其经常进行体育锻炼，增强体质；可对患者的性生活技巧进行培训，如改变性生活的体位、姿势等。
分离转换性障碍症状不是很严重可以喝中药调理，如果现在情绪很暴躁或抑郁还是配合西药一起服用。主要还是需要自己调试情绪，注意控制自己的心境，不要胡思乱想，情况稳定后可以配合传统的药物进行治疗。
妄想性障碍是以系统妄想为主症的精神障碍。在不涉及妄想的情况下，无明显的其他心理方面异常。病因不明。可能是多种因素共同作用的结果，包括生物学因素、不良的性格及精神应激。某些社会因素是本病的高危因素，如年龄较大、具有妄想性障碍家族史、社会隔离、具有特殊的人格特征、新近移民、感觉器官功能异常。
