一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
孕期卵巢囊肿的治疗方法如下：
卵巢囊肿其实就是卵巢组织异常增生而引起的肿瘤，可以是良性的或者是恶性的肿瘤，也可以是发生在单侧或者是双侧的。一般多见于20-50岁的女性，可导致女性不孕和激素水平的紊乱。怀孕后出现的卵巢囊肿分为生理性和病理性两种。如果出现一些紧急情况如囊肿蒂扭转或破裂时,临床表现为突发的腹部明显疼痛、恶性呕吐，应该立即就医进行手术治疗！
卵巢囊肿需要治疗1个月时间。最常见的治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗的方法，由于药物疗法具有一定的局限性，大部分还是要采用手术的方法进行治疗。如果囊肿直径小于5cm，没有明确症状可以不用管。
卵巢囊肿一般不能吃药进行治疗，一般可以通过手术进行治疗。激素水平异常可能会导致卵巢囊肿，如果卵巢囊肿较小，一般不会导致女性出现明显不适症状，此时吃药不能治疗卵巢囊肿，所以一般可以不进行特殊治疗。如果卵巢囊肿较大，可能会影响正常怀孕，此时药物对于卵巢囊肿的治疗作用不明显，需要及时进行手术治疗，以切除卵巢囊肿。
卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
治疗卵巢囊肿的中药主要是活血化瘀类的，常见的有当归、茯苓、益母草、桂枝、川穹等等，这些中药可能具有抑制卵巢囊肿生长的效果，甚至可使其缩小，常用的中成药有桂枝茯苓丸。需要注意的是，不同患者对中药治疗的反应不同，如果服用中药超过2个月，卵巢囊肿依然没有变小，可能需要进行手术治疗。但具体的治疗方案，需要去医院就诊后再确定。