如果形成肛瘘，任何药物或软膏通常都不起作用，必须通过手术治疗，除非是特定的肛瘘，如克罗恩病肛瘘。肛瘘是一种连接肛管或直肠与肛门周围皮肤的异性导管。它由三部分组成:一个内部开口、一个导管和一个外部开口。
应选手术治疗，内口的存在，脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎、或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管；肛门部不能静养，脓腔不易粘合：排粪、排尿时，因括约肌收缩或因炎症刺激肛门括约肌，使肛门括约肌经常处于痉挛状态。
一般出现肛瘘需要根据病情进行手术治疗，也可以采取挂线治疗，注意有没有发生肛周脓肿感染的情况，有感染的情况下就需要先治疗感染。平时一定要注意便秘，注意保持肛门局部卫生。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。
