肛瘘的治疗目标是尽可能减少括约肌损伤，消除肛瘘内口和任何相通的上皮化瘘管。手术治疗原则是将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织同时切除，使伤口自基底向上逐渐愈合。根据瘘管深浅、曲直，可选用挂线疗法、肛瘘切开或切除术。少数可行肛瘘切除后一期缝合或游离植皮。
崴脚以后首先要注意的是，不要立即进行热敷，要立即进行冷敷治疗，固定扭伤部位，不要再让扭伤部位受到外部伤害。通常扭伤后２４小时内，局部可用凉水或酒精冷敷，以促进止血，减少血肿的形成和疼痛。２４～４８小时之后，才可进行热敷，以改善血液循环。
针对肌肉酸痛的部位进行轻微按摩，逐渐加大力度，在按摩的过程中还可以加上活血化瘀的药物来促进肌肉的放松，但是不要盲目、随意进行按摩。热敷，用热水袋或者热毛巾敷在脖子酸痛的地方，松解肌肉紧张程度达到缓解落枕症状的目的。局部贴敷活血化瘀、消肿止痛功效的膏药。
在刚刚受伤的时候，要立刻去用冰敷疗法，找几个冰袋冰敷肿痛的部位，来达到消肿止痛的效果，在床上静养一段时间，在这个时期仍然需要注意扭伤部位，在休息亦或者睡觉之前，需要用枕头把扭伤的脚垫高，这样做的好处在于可以减少肿胀感，更有利于休息。
可以服用抗生素抗感染治疗，然后局部涂抹乳膏，每次排便后用温水清洗肛门，保持肛周的局部清洁，但是如果肛瘘反复发作，瘘口比较多，形成了复杂性肛瘘，使用保守的治疗方法效果不好，要选择手术治疗，主要是手术切开引流。
