一般情况下，宝宝睡觉醒来咳一阵，可以通过药物治疗、日常护理等方法进行治疗。
1.宝宝睡觉醒来咳一阵，可以使用清热解毒的喷剂，如开喉剑喷雾，起到缓解咽部红肿的作用，如果是小儿扁桃体炎引起的，可以口服小儿咽扁颗粒对症治疗。
2.宝宝睡觉醒来咳一阵，可以在晨起的时候给孩子喝杯水，缓解气管干燥刺激的作用。若长期出现上述症状，建议到医院进行过敏源检测，如螨虫、灰尘、冷空气等，查明过敏源，尽量避开过敏物质，避免刺激性咳嗽。
一般来说，宝宝睡觉醒来咳一阵可能是以下原因：
宝宝睡觉醒来咳一阵可能是有阵发性的咳嗽，主要是因为咽部的痰和炎症等原因引起的，家长可以遵医嘱给宝宝口服氨溴特罗口服液进行治疗，从而缓解身体不适。
家长应该让患儿注意休息，保持环境安静和室内空气新鲜，饮食宜清淡、易消化、富含营养，适当到户外活动，增加抗病能力。
宝宝睡醒了就哭的原因有很多，如肚子饿了，尿湿了不舒服了，白天受过度的惊吓，睡醒了没有看见大人在旁边，感觉没有安全感等。这时候先把宝宝轻轻抱起，轻拍后背，同时用温柔的语言交流，给予抚慰，让宝宝身心放松。
宝宝醒来后会哭泣，这是一种很常见的生理反应，比如饥饿、排便，或者是缺钙、肠绞痛等。
1、生理现象：宝宝醒来后会出现饿、大便等现象，如果宝宝醒来，可以及时的换掉尿片和哺乳，这样可以减轻宝宝醒来哭泣的症状。
2、病理现象：宝宝的免疫力很低，对营养素的需求很大，宝宝醒来就会哭泣，这是因为胎儿在孕期缺少钙，宝宝一出生就会缺少钙，这会引起大脑皮层的亢进，从而引起哭闹；也有一些是因为肚子受寒，或是因为频繁的哭泣造成的肠绞痛。
其实初生婴儿睡反觉是很正常的一种现象，孩子还没有完全适应从娘胎出来的环境，纠正睡反觉的方法就是要让孩子适应昼夜的替换，就是睡觉的房间要保持昏暗，白天睡觉不要太暗，保持正常，晚上睡觉也不要太亮，营造出合适的睡觉环境，限制白天睡觉的时间，一天不要超过3到4个小时。
宝宝睡觉醒来爱哭的情况下可以喂孩子吃些钙片，因为缺钙会引起孩子的哭闹，这个阶段是最容易缺钙的，必须给孩子适当的补充。孩子尽量由母亲搂着睡比较好，避免遭到惊吓，有母亲的陪伴孩子会感到很安全。尽量不要让孩子受凉，每天喂够足够的水，保持皮肤的清洁，温度要适宜，多哄哄孩子，症状自然会消失。
