进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛门镜检查不能完全看到全部直肠的情况，因为直肠的长度大概12到15厘米，肛门镜也只能看到直肠的下段，如果想看到整个直肠的情况，可以做直肠镜或者乙状结肠镜检查，不过现在这些检查都比较少了，都用电子结肠镜检查来代替了，电子结肠镜可以看到整个大肠的情况。
肛门镜是一个长约7厘米的内窥镜，可以通过直接观察到肛门直肠的病变。肛门镜的粗细大小不一，专家可以根据病患的年龄和肛门的松紧程度来选择肛门镜。因为要撑开括约肌，检查的时候多多少少会有点不舒服，轻微疼痛。
肛门镜是指检查直肠的内镜，也叫作肛门镜或直肠镜。肛门镜的长度一般为7cm，内径大小不一。肛门镜检查是肛门、直肠疾病的常规检查方法之一，适用于肛管、直肠末端及齿状线附近的病变，还可进行活体组织检查。该方法不仅简单易行，而且临床价值大。
肛门镜检查会有点不舒服，但不太痛苦，所以别担心太多。另外，对于痔疮，直肠镜检查也是一项重要的检查项目，主要是通过检查来了解病情的程度，需要根据检查结果制定治疗计划，看看是否更好地使用药物保守治疗或外科治疗。
