疱疹性咽峡炎后期会咳嗽，咳嗽是人体清除呼吸道内的分泌物或异物的保护性呼吸反射动作一般由感冒引起。得了疱疹性咽峡炎不会有咳嗽反应。虽然感冒与疱疹性咽峡炎均属于急性上呼吸道感染但疱疹性咽峡炎的病灶主要在于咽、软腭、悬雍垂(口腔中软腭后缘正中悬垂的小圆锥体。
疱疹性的咽峡炎会出现咳嗽，但是此时的咳嗽往往是刺激性的干咳，不太严重，也不会太深。出现疱疹性咽峡炎的时候，咽喉部会有疱疹，所以会刺激咽喉部出现咳嗽。另外，咽喉部还会有充血和水肿，还会有少量的炎性渗出物，也会刺激咽喉部以及气管出现咳嗽。
疱疹性的咽颊炎是病毒感染导致的一种儿科疾病，需要进行抗病毒及消炎治疗就可以了，同时还要注意生活规律及饮食卫生，少吃辛辣刺激性的食物。可以去看儿科，积极用药进行治疗，同时注意适当饮水，注意休息及卫生，慢慢就会改善过来的。
一般情况下，宝宝咳嗽流鼻涕可以通过药物治疗、生活护理来改善，具体内容如下：
上呼吸道的炎症导致婴儿出现流鼻水的症状。初期出现的症状是清鼻涕，咳嗽并不强烈，这通常5天或7天后就会自行愈合。小孩子咳嗽了很久，流了很多的脓鼻涕，要给他清洗一下，如果有咳嗽症状，可以选择化痰止咳。若仍未好转，超过1个星期或更久，应及时到正规的医疗机构就诊，明确病因。然后针对具体的原因进行针对性的处理。如果是革兰氏阳性菌或者阴性菌，可以根据具体情况来确定。如为支原体，可选用阿奇霉素等大环内酯类的药物。通常，病毒感染，可以选择蒲地蓝、蓝芩口服液等药物来进行治疗。
可以使用抗病毒药物治疗，疱疹性咽峡炎是由于疱疹病毒感染引起的咽峡部炎症，是具有传染性的，所以首先要做好消毒隔离，避免到人多的公共场所。同时饮食上增强营养，多吃一些鸡蛋，鱼虾，瘦肉等富含蛋白的食物。
疱疹性咽峡炎主要是肠道病毒、柯萨奇病毒引起的以急性发热和咽峡部疱疹、溃疡为特征的急性传染性咽颊炎。主要是侵犯1到7岁的小儿，表现为发热、咽痛、咽峡部黏膜小疱疹或者浅表溃疡为主。
