新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
乙肝疫苗和卡介苗能分开打，不在同一个胳膊。一定要分开手臂进行接种，通常是乙肝疫苗接种在右手，另一个接种左手，如果由于某些原因没能接种，乙肝疫苗接种在先，那就2周后再接种；如果后一个接种在先，那要1个月后再接种乙肝疫苗。
注射乙肝疫苗，如果是小孩子，刚出生的小孩子是免费注射的，属于国家的免费疫苗之中。但如果是成年人大约需要50块钱一针，当然不同的机构费用是相对来说会有点差别的。
刚出生的宝宝接种乙肝疫苗要进行一下乙肝五项的检查，看一下表面抗体的情况，进一步制定接种的计划。如果抗体是阴性，需要按照016的方案进行三针疫苗的接种。如果抗体是弱阳性，只需要进行一次疫苗加强就可以。
乙肝疫苗注射的第一针是在小孩出生当天，即小孩分娩出来后的24小时内，越早注射越好，第二针在出生后的第二个月，然后第六个月注射第三针，这是正常注射乙肝疫苗的方法。另外现在为了减少母婴传播的概率，还要打乙肝高效价免疫球蛋白，共打两针，出生当天和出生后的第二个月各打一针。
局部反应：疫苗接种后，可在针孔处出现红肿和硬结等现象，是短暂的炎症反应，可在接种部位发生轻度的红、肿、热、痛的炎症反应，还可能出现局部淋巴结肿大或淋巴管炎。中低度发热一般不需特殊处理可自行缓解，必要时可对症治疗。
