脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
脑炎后遗症的症状轻重不一，主要表现为神经精神方面的异常，神经异常的表现多有，发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥。重者则大脑丘脑下部底节脑干小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。
一般来说，脑炎的后遗症症状主要有：发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，甚至还会影响到大脑、丘脑下部等。
有些患者会出现兴奋多语、烦躁、哭笑无常、行为异常、失眠、记忆力减退、大小便失禁等症状。除此之外，智力下降，大脑迟钝，眼睛发麻，吞咽困难也会偶热如出现。严重的患者会出现癫痫性头痛、抽风、四肢抽搐等症状。
脑炎主要会引起脑部剧烈性疼痛，还会引起高烧，如果不及时治疗对于大脑实质会产生损害，导致部分神经元细胞坏死，从而丧失部分神经元的功能。脑炎最严重的后遗症会影响后续脑部功能恢复，导致出现智力障碍，甚至出现精神行为异常。另外常见的后遗症会导致出现偏瘫，还有感觉障碍。现在对于脑部炎症引起的后遗症没有特殊治疗办法，只能平时多加进行康复锻炼训练。
手术治疗：手术治疗在小儿脑炎后遗症患儿的临床治疗中占有重要的地位。在各种非手术治疗无效时,手术就成为重要手段。心理治疗：受病情影响，严重影响病情治疗，所以心理治疗很重要。
