造成性功能障碍的原因大致可以分成三类：生物因素、精神心理因素和文化因素。生物因素性功能障碍可能由遗传、健康状况、激素水平、年龄、疾病（包括慢性病、神经精神系统疾患、内分泌疾病、生殖器官病变）等多种原因所引起。药物、长期大量酗酒或吸毒者，也会出现性功能障碍。
男性性功能障碍可能是海绵窦血管的功能受损、心理因素、早泄等原因导致的，具体分析如下：
男性性功能障碍的主要症状是阴茎勃起功能障碍和阳痿，海绵窦血管的功能损害是导致性功能障碍的原因之一，同时也要考虑到心理因素，PDE5抑制剂可以用于治疗。还有一种是早泄，这是由于阴茎头的敏感，或是由于射精的传入神经过于激动，所以可以外用局部麻醉药物，也可以口服5-羟色胺再摄取抑制剂达泊西汀。
性功能障碍疼多考虑是由于激素水平下降或阴茎海绵体充血障碍而引起的这种表现。另外与自身的体质、不良的生活习惯、生殖器疾病、药物刺激、体内的性激素水平等因素有关系。
导致性功能障碍的病因很多，如频繁性交，吸烟，包皮过长，前列腺炎等都会引起，早泄如果没有及时的治疗，会严重挫伤男人的自信和自尊心，或影响到双方的感情，同时也会影响到正常的生育和诱发阳痿，病因不同治疗方法也不一样，建议及时去正规医院检查，对症治疗。
阳痿早泄多由男性吸烟喝酒，久坐不锻炼身体，饮食不规律引起的，随着年龄大肾虚是重要原因，补肾为关键。第二是阴茎过于敏感，可以做阴茎背神经阻断术，来降低敏感度。平常多吃些韭菜，壮阳的食物。
引起性功能障碍的原因主要有，心理因素：紧张、恐惧、焦虑、抑郁、性知识缺乏；生物性因素：激素水平的异尝龟头敏感度；疾病因素：血管蹭、包皮过长、前列腺炎、精囊炎、尿路感染、神经性疾病等、以及药物的使用等。
