患有肛窦炎可以先保守治疗，严重时手术治疗。每天用生理盐水清洗肛门，温水坐浴，注意饮食，多喝水，多吃蔬菜水果，饭后适当的运动，保持大便通畅，防止便秘。忌烟忌酒作息规律保证充足的睡眠。
孩子患了肛窦炎，首先是要注意个人卫生，每次孩子大便后应该要用温热水，将肛门部位擦洗干净，并且外用消毒液消毒，需要的时候可以口服抗炎药物进行治疗。严重时要输液来治疗。
单纯性肛窦炎可以药物治疗，如果效果不明显需要进行手术处理。采取侧卧位或截石位，进行常规消毒和局部麻醉，暴露患病的肛窦，沿探头切开肛窦，修剪伤口以保证引流通畅。术后每天进行中药坐浴，换药至病人康复。调整饮食，不吃辛辣生冷刺激性食物，不要坐在冰冷潮湿，注意个人卫生。
平常注意调理，在配合药物治疗的，一般是可以恢复的，坚持做提肛运动。建议还是少吃辛辣食物，戒烟戒酒，平常多喝水的，再配合喝点蜂蜜水，多吃香蕉。多吃富含维生素的蔬菜和水果，再配合用一比五千的溶液清洗肛门，热毛巾热敷。
需要及时的进行药物或手术治疗的，肛窦炎属于炎症感染的情况，是由于细菌感染所造成的，需要使用抗生素治疗。可以到医院的肛肠科，协助检查，明确诊断，再对症治疗。平时注意饮食清淡。
肛瓣与直肠柱之间的直肠粘膜形成许多袋状小窝，称肛窦(肛隐窝)。窦口向上，深约3—5mm，底部有肛腺的开口。肛瓣下方有2—8个三角形乳头状突起，称肛乳头。肛瓣受撕裂，可致肛裂、肛窦炎及肛乳头炎等。正常肛管内有4—8个肛腺，多集中在肛管后壁，每个肛腺开口于肛窦处。患上肛窦炎及肛乳头炎这些疾病，应该及时的去就医治疗，同时多注意日常生活起居要有规律，多注意饮食要清淡点，不要进食刺激性食物。
