新生儿乙肝疫苗接种后会出现瘙痒、红肿或伴有轻度疼痛、小硬结，这是局部皮肤反应，全身反应，可以出现发热，多数为低热，也有少数出现高热，通常一天内消退。还有的出现疲劳感。
第二针乙肝疫苗接种时间在一个月的时候接种，第二针六个月的时候接种第三针。第一针疫苗和第二针疫苗，主要是起到产生抗体的作用，应是不要推迟，第二针疫苗推迟的话也不要推迟超过一周。按时间去接种相关疫苗。
打乙肝疫苗不能够喝酒。注射乙肝疫苗，最忌讳的是发热不可以、过敏体质不可以、妊娠期不可以以及已经感染乙肝病毒的病人也不可以。喝酒可以增强身体的敏感性，也就是可以通过喝酒的方式，人为使自己变成敏感体质。
新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
新生婴儿在出生之后，就要立即的接种乙肝疫苗，同时也要注射乙肝免疫球蛋白，接种第二针，六个月左右，需要接种第三针。在接种疫苗的期间，不要出现感冒、发烧的症状，很容易影响接种的药效。
新生儿出生24小时内接种乙肝疫苗，常规的乙肝疫苗注射是016方案。
新生儿在出生24小时之内，要及时的接种第1针乙肝疫苗。如果出生24小时之后这种乙肝疫苗会影响到疫苗的预防效果。一个月和六个月的时候分别再注射后面的两针。若母亲是乙肝感染者，出生婴幼儿是低产儿、低体重儿在出生后更要加强一针，需分别在0、1、2、6个月注射乙肝疫苗。
