卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
卵巢囊肿一般需要手术治疗，手术后一般可能需要6到8周左右时间就可以完全恢复了，由于卵巢囊肿的产生与雌激素分泌过多有一定的关系，所以日常生活中一定要注意科学饮食，形成良好的生活作息，防止精神压力过大，而尽可能的避免内分泌紊乱的发生，从而导致复发。
卵巢囊肿是由炎症或巧克力囊肿引起的。卵巢囊肿是由炎症引起的，可以通过抗炎药物、中药和西药的联合治疗而完全治。治率很高。卵巢囊肿是巧克力囊肿，应通过手术治疗。然后每天热敷腹部。可以再次检查超声波，看看囊肿是否缩小。囊肿缩小，你必须考虑手术治疗。
卵巢囊肿是可以通过手术取出囊肿的。平时要多注意情绪的调节，保持心情舒畅，多休息，多吃些清淡的，少吃辛辣刺，激性过大的食物，多吃水果，多喝点热水。具体需要遵训医嘱。
卵巢囊肿的化学治疗为卵巢囊肿的主要辅助疗法。估计手术切除肿瘤困难，术前先用1～2疗程化疗，可提高手术切除术。术后应用化疗则可预防复发，手术切除不彻底者，化疗后可获暂时缓解甚至长期存活，手术无法切除者，化疗可使卵巢囊肿缩小、松动，为再次手术创造条件。这是卵巢囊肿的治疗方法之一。
多吃一些碱性的食物，如红豆、豆腐、苹果等，这是卵巢囊肿的食疗方法中重要的一项，同时也可帮助一些女性做好卵巢囊肿的预防工作，此外，在日常生活中，卵巢囊肿应以清淡饮食为主，不要吃含油较多或者是刺激性比较的食物。在医生指导下对症治疗，可以考虑保守治疗，如果有特别严重的症状也可以考虑手术切除治疗。
