藿香正气水的主要作用是用于治疗胃肠感冒，或者胃肠炎症见脘腹胀痛、呕吐、泄泻或者发热、头痛、头昏、身痛等，此时的腹痛，症状较轻的可以喝藿香正气水缓解，但是如果疼痛特别严重，这种药物没有止痛的作用。
发烧用藿香正气水贴肚脐，有一定的退热的效果。藿香正气水是一个中成药制剂，可以有消暑降温的功效，用来治疗腹胀、腹痛、呕吐、腹泻以及胃肠型感冒等，有良好的疗效。由于里面含有酒精，敷在肚脐的时候，通过体表酒精的蒸发，将体内的热量散出去，达到物理降温的目的。但是一般适用于体温在38.5度以下时。
一般情况下，宝宝发高烧用藿香正气水通常不能退烧。藿香正气水由苍术、陈皮、厚朴、白芷等药材制成，有解表化湿、理气和中的功效与作用，有助于缓解头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛等症状，但通常对退烧并没有明显的作用，因此，宝宝发烧用藿香正气水通常不能退烧。此外，藿香正气水含有酒精，一般不建议给宝宝用。宝宝发高烧时可以通过枕冰袋、敷毛巾等方式来物理降温，并遵医嘱使用如布洛芬颗粒、对乙酰氨基酚颗粒等药物来退烧，以免引起高热惊厥。
一般情况下，给宝宝洗澡放藿香正气水能够起到清热去湿的作用。
藿香正气水主要由苍术、陈皮、厚朴、白芷、茯苓、大腹皮等多种药材制作而成，具有解表化湿、理气和中等功效，如果宝宝对藿香正气水不过敏，给宝宝洗澡放藿香正气水，能够起到清热去湿的作用，有助于缓解痱子、皮疹、湿疹等病症，可以让宝宝洗澡后感觉到清爽、舒适。
藿香正气水小孩不能喝，因为孩子胃肠消化功能发育还不完善。此药物具有解表化湿，理气和中的作用。可用于外感风寒，内伤湿滞或者夏月暑湿所致的感冒，症见头疼昏重，胸膈满闷，脘腹胀痛，呕吐腹泻，或者是胃肠型感冒皆可应用。
有一定的去湿作用。藿香正气水由苍术，陈皮，厚朴（姜制），白芷，茯苓，大腹皮，生半夏，甘草浸膏，广藿香油，紫苏叶油等成分制成，其中藿香作为主药，具有芳香化湿，理气和中的作用，另外苍术、厚朴、大腹皮有燥湿除满的功效；配茯苓、甘草也有健脾利湿，加强运化功能的好处，这些药物搭配使用，对于湿气重的患者可起到解表化湿，理气和中的效果，但并不是所有的湿气都能去除，还需对症使用才有效。
