比较小，单一的附睾囊肿是不需要治疗的，如果是比较大的囊肿，或者短时间内增大的囊肿，或者是多发的附睾囊肿可以考虑手术进行切除，一般是手术过程中用蚊式钳分离附睾囊肿，把囊壁完全切除即可。
附睾囊肿是因为性刺激，或感染因素引起的，也可能是精子的管道不通畅引起的。常常表现为睾丸胀痛，坠胀感。患处常常表现为有肿块。如果症状不明显，没有发展的趋势，不需要治疗。
如果计划进行穿刺检查，通常在住院后进行。这表明必须选择正规的公立医院进行泌尿外科治疗，而不是一些所谓的私立男性医院。治疗后，应该首先向接受治疗的医生解释目的。经彩色多普勒超声、穿刺等检查后，应确保诊断后有针对性的治疗。
为了保证治疗效果和更好的恢复，必须要住院治疗，以免影响术后恢复。附睾囊肿是临床产科常见的一种疾病，一般的药物治疗是没有什么效果的，采取手术治疗是最有效的治疗方法。
手术一般是没有问题的，附睾头囊肿手术切除多余的囊肿并不是切除附睾，囊肿是属于良性病变，要先进行穿刺抽液，附睾及附睾囊肿切除后，后续应该配合消炎消肿治疗。平时要多卧床休息。
如果囊肿比较小，没有临床症状，不用处理，不会影响健康。不能总比较大，同时有症状出现，比如最胀疼痛，或者是，有其他临床表现，应该考虑手术治疗！目前首选的手术方式是微创手术，创伤小，恢复快，不会对日常生活造成影响。