通常情况下，宝宝扁桃体发炎发热可以通过药物进行治疗。
宝宝扁桃体发炎发热通常认为是由于细菌感染引起的，会有短暂的咽痛、吞咽疼痛、吞咽困难等症状，同时还会导致两侧扁桃体充血肿胀。治疗上要进行血液常规的化验，主要是用头孢类的消炎药、输液、口服等。高热的时候体温在38度5、以上，可以适当的服用退烧药，宝宝可以选用退热栓，因为它的副作用比较少。
小儿扁桃体炎多数与病原微生物感染所致，其主要致病菌是乙型溶血性链球菌。常常出现发热、咳嗽、咽痛、吞咽困难、扁桃体肿大、扁桃体充血，严重者可出现高热不退。要积极给予抗感染治疗，结合辅助检查针对性选择合适的药物，治疗2-3天后，如果效果不明显，做药敏实验确定致病菌。并给予漱口水冲洗扁桃体隐窝，以起到抑菌消炎的作用。
考虑急性化脓性扁桃体炎。急性化脓性扁桃体炎的主要症状是剧烈咽痛，常放射至耳部，伴有吞咽困难。严重者（尤其是幼儿）常有畏寒、高热、头痛等全身症状。需要使用消炎杀菌的药物，必要时可以检查扁桃体是否发生病变。
需要及时的化验一下血分析，明确发热的原因，先口服药物退热处理。再根据检查的血象情况，消炎抗病毒治疗，稳定病情，以免反复发热。宝宝身体差，免疫力低下，容易导致病菌感染，出现，自身免疫性的调节，引起扁桃体发炎肿胀增大。病情加重，会影响体温调节中枢的，体温调节功能，使机体的产热增多，散热减少，表现为体温高于正常。
小孩扁桃体发炎可能是病毒、细菌等致病微生物引起的。
一般情况下，引起小孩扁桃体发炎的因素可能是病毒，如
鼻病毒、冠状病毒及腺病毒、副流感病毒、疱疹病毒、流感病毒、肠道病毒等。此外，小孩扁桃体发炎还可能是细菌引起的，通常有A组乙型溶血性链球菌、肺炎链球菌、流感杆菌等。此外，如果小孩受凉或者过度劳累，就可能会导致病毒、细菌等侵入机体，导致免疫力下降，不利于身体健康。
感冒引起扁桃体发炎，大多数是因为病毒感染的侵犯所造成的，出现感冒扁桃体发炎最为常见，这种情况对于病毒感染所引起的扁桃体表现的要轻一些，通常不会有严重的症状发生，采取多喝水、多休息，在7天到10天能够慢慢恢复，但是存在频繁感冒，这种情况属于细菌感染，这时候身体的免疫力会低下，细菌从此会爆发，需要到医院让医生通过手术切除来治疗。
