房颤治疗首先应维持窦性心律。通过药物转律、电转律的方法使房颤转变为正常心律，具体方式由患者的具体情况决定。目前较常用的非药物治疗是手术，可采用射频消融术或迷宫手术进行治疗，使房颤心律转为窦性心律。当患者心律不能转为窦性心律或不能维持长程窦性心律时，应降低心室率，可运用β受体阻断剂进行治疗，必要时需综合评估患者出血与栓塞的风险，进行抗凝治疗。
通常情况下，绝大多数的房颤患者需要长期吃药。
房颤患者有较高的心室率，如果长期不能很好的控制心律失常，就会有心跳过速、心肌缺氧等症状，从而引起心功能的降低，这时候要口服倍他乐克等稳住心跳的药物。此外，房颤还会导致心脏出现血栓，一旦发生血栓，很有可能导致心因性脑中风。因此要评价心房颤动的发生，需要使用诸如华法林利伐沙班等口服抗凝剂来预防血栓。
房颤时心房丧失收缩功能，血液容易在心房内淤滞而形成血栓，血栓脱落可随着血液至全身各处，导致脑栓塞、肢体动脉栓塞等，心率快和节律不整齐可使病人感到心悸，心房收缩功能丧失和长期心率增快可导致心力衰竭，心房纤颤病人应及时就诊，积极治疗，预防血栓栓塞和心力衰竭的发生。
早搏一般不会引起房颤，房颤一般是由其他原因导致的，但是在出现房颤之前有可能会有频发的房性早搏，然后随着疾病的进一步发展有可能会转变为房颤，主要是见于风湿性心脏瓣膜病尤其是二尖瓣狭窄，左心房扩大的时候一开始可能是频发的房性早搏甚至出现房扑，随着疾病的进一步发展就有可能会引发的心房颤动。
治疗房颤的药物就是抗心律失常类的药物。这类的药物主要用于控制心房颤动的心室率，也就是说，使心跳变慢。然而，它们偶尔具有负转换功能，可以将心房颤动转换成窦性心律。