目前治疗的主要方法还是选择尽早的进行手术治疗，然后进行化疗和放疗的建议，化疗后便需要应用一些增加免疫力的药物，增加身体的抵抗力，这样才能够保证放疗的顺利进行。同时也需要定期进行复查。平时注意休息，饮食宜清淡，避免辛辣和油腻，避免情绪激动和劳累。
肝胆管结石可引起腹痛和全身皮肤粘膜发黄，从而引起梗阻性黄疸。应该尽早手术治疗。肝胆管结石比单纯胆石治疗相对更难治疗。因此尽早进行肝胆外科手术进行对症治疗。应根据个人情况选择合适的手术，尽早清除结石，避免并发症。
肝门胆管癌恶性程度较高，但如果早期得到及时的手术及后续的综合治疗，存活在5年以上可能性较大。但很多肝门胆管癌发现时病程偏晚伴有远处转移，或病人肝功能不能耐受手术，只能行介入治疗减轻症状，一般寿命明显缩短，平均在半年。肝门胆管癌发现为晚期病人，不能接受任何治疗或放弃一些综合治疗，寿命一般只能维持2个月。
肝门胆管癌，该情况则是无法采取手术治疗。对于病人则是需要采取介入栓塞治疗，其次则是需要采取中药辅助抗肿瘤治疗，尽可能地延长时间及提高生活质量。保持心理愉快，多散步，呼吸新鲜空气，吃清淡食品。
晚期胆管癌，可能生存期比较短，恶性程度比较高，可以考虑吃中药抗癌治疗比较好，可能难以介入治疗，可以中药抗肿瘤，增强病友抵抗力，有助于延长生存期，注意平时少吃多餐，加强营养，吃点鸡蛋，牛奶，有助于提高病友生活质量。
肝门部胆管癌的首选治疗方式是手术切除，血管骨骼化、联合肝叶切除、扩大淋巴结清扫和胆道重建是肝门部胆管癌根治术的主要方面。必要时联合各类肝叶和血管切除技术，可以提高切除成功率。
