眼部扁平疣一般会自行愈合。
扁平疣是由病毒感染引起的，有传染性可自行接种，扁平疣有轻微的瘙痒，搔抓后再接触其它部位的皮肤，有可能出现新的疣体长出。患处擦维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏、病毒灵、异维A酸胶囊等。在治疗过程中要注意不能吃辛辣刺激性的食物，平时可以多吃一些清淡的食物，尽量不要去搔抓，要多运动，提高身体的免疫力。
需注意，眼部扁平疣一般持续1-3年，建议早期发现早治疗。
一般情况下，眼部扁平疣能治愈，具体内容如下：
眼睛扁平疣一般是人体受到病毒感染引起的，所以扁平疣是一种具有传染性的疾病。一般都是在眼睛周围出现，如果不小心搔抓会引起疣体的蔓延，可以在医生指导下使用维甲酸乳膏、干扰素凝胶、咪喹莫特软膏等涂抹在患处，进而可以起到治疗作用。并且患者在治疗之前要把毛巾、脸盆等与别人隔离起来，避免相互传染。
扁平疣是由人类乳头瘤病毒引起的，大部分都是骤然出现，通常为针头至米粒大或稍大的扁平丘疹，呈圆形或不规则形，略高于皮肤表面，也可显著地凸起而形成圆顶状.表面光滑，境界清楚，触之较硬，为浅褐或灰白，淡黄或正常皮色.大部分散存在或密集成群。
治疗方法有很多种，可以选择免疫调节剂以及抗病毒的药物或者局部激光等治疗措施。有这种疾病一般是不会导致疼痛的，只是皮肤粘膜凸出皮肤.和皮肤颜色一样的一种皮疹。如果伴随疼痛的话，有可能是属于带状疱疹，需要到医院去看看。
扁平疣是一种dna病毒，人是它的唯一宿主，宿主细胞是皮肤和粘膜上皮细胞，病毒存在于棘层细胞中，并可促使细胞增生形成疣状损害。疣可通过直接接触传染，亦可通过污染物间接传染。及时的挂个皮肤科，及时的给予抗病毒对症的药物口服，也可以使用激光治疗。
其实眼部扁平疣的治疗方法还是挺多的，激光治疗法就是其中的一种。激光治疗眼部扁平疣这个疾病的原理是应用激光仪产生的高强度的光束，而对扁平疣这个疾病进行很好的治疗，治疗完后，最大的好处是，没有疤痕的印记，所以利用激光治疗眼部扁平疣这个疾病是很多人采用的治疗眼部扁平疣这个疾病的方法。
