新生儿疾病筛查一般是不会对查宝宝的大脑进行检查的，通常是选择血液检查的方式。
新生儿疾病筛查通过实验室新生儿血液检查，为了及早发现一些先天性和遗传性的疾病，代谢性疾病的发生，经过及时而有效的处理，避免造成儿童智力体格发育障碍和其他严重的危害的出现。通常靠采足底血，并没有直接对宝宝大脑进行考察。检查大脑可以通过脑部ct的方式。
新生儿疾病筛查是指通过血液检查对某些危害严重的先天性代谢病及内分泌病进行群体过筛，使患儿得以早期诊断，早期治疗，避免因脑、肝、肾等损害导致生长、智力发育障碍甚至死亡。检查项目一般包括苯丙酮尿症、枫糖尿症、组氨酸血症、半乳糖血症等。对阳性可疑病例，则进行复查，若仍为阳性则需要进行反馈。在检查前，建议按摩或热敷婴儿足跟，使其充血。
新生儿眼底筛查对及时发现早产儿视网膜病变和其他眼底病变有重要意义。眼底筛查或者眼底照相不会对宝宝带来多大的危害。眼底筛查前需要用滴眼液散瞳，滴眼药水可能会给宝宝带来不舒服的感觉，但都能耐受。
新生儿的听力筛查属于新生儿的一种。听力受损，先天聋哑，若没有及时的诊断和介入，可能造成终身的失聪，从而造成终身的失聪，从而对以后的学习和生活造成极大的负面作用，所以新生儿的听力筛查是非常必要的，新生儿的早期筛查是新生儿的最好时机，如果出现听力问题，或者是简单的听力检测没有过关，应该在六个星期内到专业医院进行一次。
一般来说，新生儿眼底筛查主要是发现新生儿眼病。
新生儿眼底筛查可以通过检查孩子的视网膜、黄斑是否存在有问题发现新生儿眼病。新生儿眼底筛查主要针对早产儿，因为早产儿在宫内可能发育不完善，比较容易引起视网膜发育不良或者病变，可以通过新生儿眼底筛查做到早期发现、早期治疗、早期干预，对孩子预后比较好。家长可以遵医嘱进行检查。
新生儿出生后自然睡眠或安静状态下通过耳发声器和声阻抗等电生理学检查听力。主要分为早期筛查和复查，早期筛查一般选择新生儿出生3-5天进行筛查，首先清理耳道，在宝宝睡眠安静的状态下，将大小合适的探头或耳罩放置在婴儿的一侧耳朵开始进行测试，做完一侧耳朵再做另外一侧，仪器自动显示结果。如果没有通过，可重复2-3次测试。
