通常情况下，儿童脑炎好了头疼可能是脑炎的后遗症。具体情况分析如下：
脑炎是大脑实质的急性炎症，一般会出现发热、恶心、呕吐、意识模糊、头疼等症状，如果儿童之前的病情较为严重，或者未及时进行治疗，可能会出现儿童脑炎好了头疼的情况，家长可以按照医嘱给儿童使用安宫牛黄丸、清热醒脑灵丸、安脑丸等药物进行治疗。家长还可以按摩儿童的头部，缓解儿童的头疼。
病毒性脑炎头疼表现的部位是不一样的，也不是确定的某个区域。病毒性脑炎由各类病毒引起，由于病毒毒性、侵犯脑内部位不同，引发的症状也不同。病毒性脑炎主要症状为精神行为异常，可引起肢体无力，头痛，呕吐，甚至偏瘫。
脑炎引起的脑部神经痛的症状，劳累后或是长时间脑力劳动会造成疼痛的症状，属于神经损伤性疼痛。要注意休息，适当多饮水。适当调整好自己的情绪和生活作息习惯，补充营养。
首先要排除有病毒感染造成的后遗症的情况。去医院检查一下血象或者是脑部的多普勒，根据检查结果再考虑针对性用药。这几天可以多喝水，加速药物从体内代谢，同时多注意休息。
脑炎的头痛的部位通常是以前额部为主，前期有发热感冒、头痛、呕吐不止、腹泻等明显的表面症状。平时注意观察孩子的情况，具体的询问下看孩子是哪个位置疼痛。注意孩子的饮食，不要乱吃膨化食品。
病毒性脑炎恢复的周期在1-3个月的时间，现在头疼可能是一个恢复后期的表现。现在要到专业的儿童医院，必要时可以选择脑脊液的穿刺检查，这样才能做出一个明确的判断。一般并不会有明显的疼痛现象。
