导致鳞状上皮细胞增生的原因，主要是病毒感染和炎症刺激，比如持续的HPV感染，也就是人乳头瘤病毒感染，某些高危型的人乳头瘤病毒持续感染，可以造成宫颈鳞状细胞非典型增生，诱发宫颈癌。
粘膜慢性炎伴鳞状上皮异型增生，一定要及时的采取治疗措施，如果治疗不及时，很有可能发展为非典型增生，非典型增生，属于癌前病变，需要尽快用药物控制炎症，平时一定要少吃辛辣刺激性的食物，如果身体有不舒服的症状，一定要去做胃镜的检查。
是慢性胃炎的表现有异常增生情况，也就预示着有恶变的可能，幽门螺杆菌感染是慢性活动性胃炎、消化性溃疡、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤和胃癌的主要致病因素。目前有幽门螺杆菌的三联疗法和四联疗法的。
尽早手术切除送病检。以免时间长了而病变。术后结合中医中药辩证调理治疗，平常多注意，忌辛辣刺激食物，忌烟酒，不要熬夜。是需要进行定期的检查，必要的时候是需要进行规范的手术治疗，来进行专业的治疗和分析的定期的复查。
尿检中鳞状上皮细胞高是一般是没有什么临床意义的，但是如果出现大量增多，并且伴有白细胞增多现象，就提示有可能是患有泌尿系统炎症，如鳞状上皮细胞在男性尿中大量出现，一般见于前列腺患者接受激素疗法（雌激素疗法）时或尿道寄生阴道毛滴虫。
针对于肺部慢性炎症，必要时可以取痰液做病原体的培养，做一下药物敏感实验，确定病因进行病因治疗。比如抗细菌，抗结核，抗支原体，抗真菌等的治疗。在使用药物过程中要注意定期复查肝肾功能，防止肝肾功能受损。
