生殖器疱疹病毒的治疗方式主要如下：
1.确诊后可以使用阿昔洛韦软膏等抗病毒药物，连续使用两三个星期；
2.水泡全部消除后，可以继续应用干扰素注射液进行全身注射，可以将病毒完全清除，防止复发。
生殖器疱疹病毒主要是因为不干净的性接触而感染导致，主要症状是生殖器疱疹。该情况多发于生殖器附近的微小局部，可表现为明显的小水泡。一般来说，该感染可通过检查生殖器疱疹病毒抗体进行确诊。
生殖器疱疹属于单纯疱疹病毒2型，感染后会出现反复发作的情况，可以是通过性接触，也可以是接触物传播。第一次接触感染源后，通常在3-10天内发病，在生殖器上会出现小的水泡，可以是单独的，也可以是多个簇集性的水泡，只有在水泡破裂后出现了溃疡，才会出现比较剧烈的疼痛。抗病毒的药物可以按照疗程服用，但是单纯的外用药物是有一定的作用的，而且要尽快的进行治疗，尽量的隔离，以免传染给别人。
生殖疱疹病毒可以用药物缓解，但是无法治好，所以一定要检查用药，而且要注意局部卫生，避免再次复发引发其他并发症的，饮食上要注意清淡，不要过度饮酒抽烟，观察分泌物看看。
生殖系统病毒感染，需要根据不同的病毒，服用不同的药物。
如果患者感染的是梅毒螺旋体，所以治疗以青霉素为第一选择；如果是病原性淋球菌，可以通过肌肉给药，比如大观霉素、头孢曲松等。单纯疱疹病毒是导致感染的主要原因，可以服用类似于阿昔洛韦，更昔洛韦等的药物。
HPV是由人乳头瘤病毒引起的，通常发生在宫颈的部位，通常会引起宫颈的炎症，从而引起上皮内瘤样变，从而引发子宫内膜癌、宫颈癌等。
大多数的宫颈上皮内瘤变和宫颈上皮内瘤变都是因为HPV16和18。HPV病毒感染后，首先要考虑到有没有尖锐湿疣或者宫颈疾病，从而进行针对性治疗。
生殖道感染的大部分是人乳头瘤病毒。
人乳头瘤病毒可导致人的表皮及黏膜增生性病变，低危型人乳头瘤病毒侵染生殖道时，可导致生殖器尖锐湿疣的发生。高危型人乳头瘤病毒在生殖道感染后，可导致阴道和宫颈上皮内病变，持续性感染可增加宫颈癌及其他恶性肿瘤的发病机会。在治疗上应当选择药物进行干预，还可采用液氮冷冻、激光、电灼等方法治疗。
