这种疾病的治疗宜尽早控制感染，祛除诱发肾盂肾炎的不良因素和对症处理。同时肾盂肾炎要卧床休息和高热量、高维生素饮食有助于机体恢复，重要的是给予足够的水分冲洗尿路，鼓励多饮水以保持足够的尿量。
男性尿道炎阴囊痒尿潜血先检查的目的是检查是否有红细胞尿，但后来发现，除红细胞外，其他成分如尿液中肌红蛋白、血红蛋白可以导致隐血阳性，此外，正常的人类红细胞已死，其成分也从尿液中排出，所以正常的人有时也会出现在尿隐血阳性。这么说吧，对正常人来说，排尿潜血阳性并不重要，也没有必要治疗。
尿潜血三个加号，其实并不意味病情严重，潜血指标的高低，并不代表肾炎的轻重程度，不是说潜血三个加号比潜血一个加号病情严重，潜血指标也不反映肾脏病后期的发展方向，并不是说潜血三个加号患者发展到肾衰竭、尿毒症的概率就比了潜血一个加号的患者严重。
肾盂肾炎可分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎。急性肾盂肾炎的治疗主要控制感染，慢性肾盂肾炎多数无明显临床症状，可定期监测尿常规及尿培养，药敏进行抗感染治疗。
血尿的主要原因为肾小球肾炎或泌尿系统结石。有是一些结石做彩超难以发现，所以应该做泌尿系统X光检查以帮助诊断该疾病。还要通过化验肾脏功能，和膀胱镜的检查，来得到进一步的明确。
