口腔溃疡的治疗主要分为诊室的治疗及回家后的护理。诊室治疗主要是双氧水和生理盐水交替冲洗，洗掉溃疡表面的食物残渣及菌斑，之后使用药物治疗，以减轻溃疡疼痛。回家后的护理需病人保持口腔卫生，饭后漱口、刷牙，减少菌斑，有利于溃疡的愈合，延长溃疡的静止期，避免溃疡在短时间内不再复发。
预防口腔溃疡的主要的方法是科学的因素和多吃蔬果等，适当的补充维生素，才能避免复发的，平时少吃上火的东西，建议平时避免粗糙过烫食物对黏膜的刺激，营养均衡，饮食清淡，保持有规律的进餐习惯。
饮食上，口腔溃疡病人避开一些辛辣刺激的食物，但可以适量补充蔬菜、水果和蛋白质。口腔溃疡病人可以吃鱼肉。但要注意，不可食用烤鱼或比较辣的鱼，避免因食物过于辛辣刺激而导致口腔溃疡发作，可以吃一些清蒸的鱼或喝鱼汤。
口腔溃疡是有一定自愈性的，大约一周左右就会自愈，和很多因素都有关系，比如机体的抵抗能力，平时吸烟饮酒，食用辛辣刺激性的食物，可以用些促进伤口愈合的药水或者凝胶涂抹。
口腔溃疡一般一到两周可以自愈，如症状较重疼痛明显，可以口服消炎药物及漱口液漱口，补充维生素C，饭前用漱口液漱口止痛，食物以微温或凉的流质为主，超过两周仍不愈合，建议到正规口腔门诊就诊检查。
