甲沟炎主要与细菌感染有关，还没有成脓的情况，患者可以在医生的指导下外用一些消炎制剂外敷，以及口服一些消炎药进行联合对症治疗。如果成脓的话就要切开清脓脓液，并积极的进行抗感染治疗。
轻度的甲沟炎或者初起，甲沟部位红肿，疼痛，可以去药店买来碘酒，沾上棉签，涂抹在患处，并用棉签用点力按压在患处，让药力渗透到里面，反复多次，可以起到治疗的目的。保守的治疗是可以使用抗生素、镇静消炎的药物等。严重的话需要采取手术治疗。
轻度的可以通过静脉抗感染治疗的方法，同时也可以选择外用药物，应用碘伏消毒或应用高渗盐水进行浸泡，有辅助的消炎的作用。而严重的甲沟炎，如果并发脓性指头炎，患者还会出现寒战高热，甚至诱发骨髓炎发生，应该及时选择手术进行切开引流。
两个月宝宝脚大拇指甲沟炎可以局部涂抹消炎、消肿药物治疗。同时口服消炎药物效果会更好。平时注意脚部卫生，勤洗脚，剪指甲。穿的鞋子也一定不要太小了，不舒服的同时还容易不透气，容易引起感染。
采用中医治疗甲沟炎也是极为有效的，取黄连、大黄等，必须要进行捡净处理，且要烘干，之后研末保存起到备用，使用之前用醋进行调匀，外敷在发病的部位，每天应当注意清洗，还要更换药物，且要注意宝宝的卫生，衣物也要经常更换，居室的环境也要多加注意。
目前有效地治疗甲沟炎长肉芽的方法是把趾甲边缘切除一小条，然后把甲根生发层进行处理，使趾甲边缘不再有新的趾甲长出，以达到治疗嵌甲的目的。手术时间短、恢复时间短、创伤小、术后病人痛苦少、术后不影响清洁、不影响洗脚。注意饮食护理。